UMAP vs Tsne Sel Tunggal

1. Apakah umap lebih baik dari t-sne?
2. Mengapa UMAP unggul daripada T-SNE?
3. Apa yang lebih baik dari UMAP?
4. Apakah UMAP lebih baik dari PCA?

Apakah umap lebih baik dari t-sne?

Berkat solusi dalam membangun grafik dimensi tinggi, UMAP secara teoritis menghemat lebih banyak waktu dan biaya perhitungan daripada T-SNE. Dilaporkan bahwa pengurangan dimensi dataset dari 784-D menjadi 3-D hanya membutuhkan UMAP 3 menit, sementara itu mengambil T-SNE 45!

Mengapa UMAP unggul daripada T-SNE?

Namun, matematika di balik keduanya sangat berbeda. Sementara TSNE murni untuk tujuan visualisasi, UMAP jauh lebih dari itu. Untuk komunitas Scrnaseq, yang paling penting mungkin adalah baik -baik saja untuk mengelompokkan komponen UMAP sementara ini bukan kasus untuk TSNE.

Apa yang lebih baik dari UMAP?

IVIS mengungguli UMAP dalam menjaga struktur global dan harus dipertimbangkan untuk banyak aplikasi pengurangan dimensionalitas.

Apakah UMAP lebih baik dari PCA?

UMAP mengungguli T-SNE dan PCA, jika kita melihat plot 2D dan 3D, kita dapat melihat cluster mini yang dipisahkan dengan baik. Ini sangat efektif untuk memvisualisasikan cluster atau kelompok titik data dan kedekatan relatifnya.